4.1. Руководство деятельностью фонда осуществляется правлением.
Состав правления утверждается администрацией края. В состав правления входят представители администрации края, общественных и государственных организаций, деятельность которых направлена на решение природоохранных задач.
Председатель правления фонда избирается на общем собрании членов правления простым большинством голосов.
Правление подотчетно в своей деятельности администрации Красноярского края.
4.2. К компетенции правления фонда относятся следующие полномочия:
образование исполнительной дирекции фонда, назначение исполнительного директора фонда;
утверждение структуры, штатного расписания и сметы расходов на содержание исполнительной дирекции, а также положения об исполнительной дирекции и ревизионной комиссии;
утверждение бюджета фонда, финансовых отчетов и смет расходования средств;
предоставление бюджета фонда, сметы финансирования программ, годовых отчетов и сметы использования средств, структуры инвестиций для утверждения Красноярским краевым Советом народных депутатов;
принятие решений по финансированию реализации экологических программ, проектов, научно - исследовательских разработок, других мероприятий в соответствии с утвержденными направлениями расходования средств;
определение приоритетности предлагаемых для финансирования программ и проектов;
иные вопросы деятельности фонда.
4.3. Правление фонда осуществляет свою работу в форме заседаний на регулярной основе, но не реже одного раза в квартал. Решения правления принимаются простым большинством голосов присутствующих на его заседании членов.
4.4. Правление утверждает положения об отделениях, филиалах и иных обособленных подразделениях фонда.
4.5. Контроль за финансовой деятельностью фонда осуществляет ревизионная комиссия, образуемая из представителей (по одному человеку) Красноярского краевого Совета народных депутатов, администрации Красноярского края и Красноярского краевого комитета по охране природы.