Выполнению поставленных задач могут помешать риски, сложившиеся под воздействием негативных факторов и имеющихся в обществе социально-экономических проблем.
При оценке основных рисков реализации мероприятий государственной программы можно выделить внутренние и внешние риски.
Внутренние риски включают в себя нарушения в деятельности работников госветучреждений области, приведшие к незапланированным и неэффективным расходам бюджетных средств. В целях контроля и минимизации данного риска планируется развивать систему внутреннего контроля и аудита на ведомственном уровне.
Внешние риски включают в себя возможное изменение законодательства в области качества и безопасности продуктов питания, несоблюдение поставщиками сроков и объемов поставки биопрепаратов.
В целях минимизации данного риска, в связи с рассмотрением нового проекта закона Российской Федерации "О ветеринарии", которым предусматривается дальнейшая передача полномочий, управление предполагает реализацию мер правового регулирования посредством внесения изменений в ряд нормативных правовых актов для обеспечения их соответствия действующим механизмам управления в сфере ветеринарии.
Кроме этого, угрозу ветеринарно-санитарному благополучию представляет целый ряд причин и факторов риска:
возникновение чрезвычайных ситуаций природного или техногенного характера, угроза биологической безопасности;
глобальное ухудшение эпизоотической ситуации в странах дальнего и ближнего зарубежья;
нестабильность эпизоотической обстановки в регионах Российской Федерации;
вероятность новых вспышек заразных болезней в ранее неблагополучных пунктах Брянской области;
систематическое нарушение технологий переработки, перевозки, условий хранения и реализации продукции и сырья животного происхождения, кормов и кормовых добавок.