Текущее управление программой осуществляет заказчик - комитет по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области.
Заказчик программы:
с учетом ежегодно выделяемых на реализацию программы средств распределяет их по программным мероприятиям;
обеспечивает целевое и эффективное использование средств, выделяемых на реализацию программы.
Контроль за исполнением программы осуществляется администрацией Брянской области.
Проведение работ по организации семеноводства, семеноведения, сортовой и семенной политики на территории Брянской области осуществляет комитет по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области, который в своей деятельности руководствуется законодательством Российской Федерации. Он же координирует работу исполнителей по реализации программы. Может вносить предложения в администрацию Брянской области по вопросам корректировок финансирования, совершенствования методов выполнения мероприятий.
Закупаемые сорта сельскохозяйственных растений должны быть включены в Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию в производстве.