Государственным заказчиком программы является администрация Брянской области, которая осуществляет координацию деятельности участников программы.
Общий контроль за реализацией программы осуществляют комитеты по экономической политике и по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области.
Заказчики и исполнители мероприятий несут ответственность за их качественное и своевременное выполнение, рациональное и целевое использование финансовых средств, выделенных на реализацию программы.
Комитетом по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области устанавливается регулярная отчетность государственных учреждений - районных управлений сельского хозяйства, образовательных и научных учреждений о целевом и эффективном использовании выделенных бюджетных средств (в ред. Постановления администрации Брянской области от 06.06.2006 N 346).
Комитет по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области на основании отчета распорядителя средств областного бюджета представляет финансовому управлению Брянской области ежемесячно не позднее 25 числа месяца, следующего за отчетным периодом, отчет об использовании средств областного бюджета.
Порядок использования средств по мероприятиям программы утверждается нормативно-правовыми актами администрации области.
Ежегодно ход реализации программы обсуждается на коллегии комитета по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области.
По итогам реализации мероприятий программы комитет по сельскому хозяйству и продовольствию Брянской области ежемесячно представляет отчет в администрацию и финансовое управление Брянской области.