Контроль за выполнением программы осуществляет департамент здравоохранения Брянской области.
Заказчик программы и исполнители мероприятий несут ответственность за их качественное и своевременное выполнение, рациональное использование выделяемых на эти цели финансовых ресурсов.
Заказчик программы ежемесячно, не позднее 15 числа месяца, следующего за отчетным месяцем, направляет в специально уполномоченный орган справочную и аналитическую информацию о реализации программы.
Заказчик программы ежеквартально, не позднее 20 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, представляет в специально уполномоченный орган подробную информацию об использовании средств, выделенных на реализацию программы.