Текущее управление реализацией программы и контроль за ее исполнением осуществляет администрация Брянской области.
Общий контроль за реализацией программы осуществляет комиссия по информационной безопасности при Губернаторе Брянской области.
Отдел безопасности организует ведение отчетности исполнителей, ежеквартально представляет отчет, справочные данные и аналитическую информацию в комитет по экономической политике Брянской области и финансовое управление Брянской области, ежегодно уточняет затраты по программным мероприятиям конкретных исполнителей программы.
Результаты реализации программы комиссия по информационной безопасности при Губернаторе Брянской области рассматривает на своих заседаниях по итогам полугодия, года и по окончании сроков реализации программы.