Комиссия действует на основании Положения, утверждаемого губернатором Сахалинской области. Комиссия определяет приоритетность направления средств регионального фонда, рассматривает заявки и предложения от предприятий, организаций, исполнительных органов местного самоуправления, а также департаментов, комитетов, управлений администрации Сахалинской области, осуществляет распределение средств регионального фонда, определяет конкретные условия и сроки предоставления и возврата средств регионального фонда.