Государственным заказчиком Подпрограммы является департамент здравоохранения Кировской области, который реализует ее мероприятия в соответствии с действующим законодательством.
Департамент здравоохранения Кировской области осуществляет реализацию Подпрограммы на основе государственных контрактов, заключаемых на конкурсной основе в соответствии с Федеральным законом от 21 июля 2005 года № 94-ФЗ "О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд".
Для реализации мероприятий Подпрограммы департамент здравоохранения Кировской области ежегодно направляет в Министерство здравоохранения и социального развития Российской Федерации информацию о ходе выполнения Подпрограммы, эффективности использования средств федерального бюджета и заявки с целью привлечения средств из федерального бюджета в рамках реализации мероприятий подпрограммы "Здоровое поколение" федеральной целевой программы "Дети России" на 2007 - 2010 годы.
Департамент здравоохранения Кировской области в установленном порядке направляет информацию о ходе выполнения Подпрограммы, эффективности использования финансовых средств государственному заказчику-координатору Программы.
Контроль за ходом реализации Подпрограммы осуществляют в установленном порядке Законодательное Собрание Кировской области, Контрольно счетная палата Кировской области, Правительство Кировской области, департамент образования Кировской области.
В случае несоответствия результатов выполнения Подпрограммы показателям эффективности, предусмотренным Подпрограммой, государственный заказчик Подпрограммы готовит и вносит в установленном порядке предложения о корректировке Подпрограммы либо о досрочном прекращении реализации Подпрограммы.