Основные риски реализации мероприятия связанны с внедрением на местном уровне бюджетирования, ориентированного на результат, требующего значительных временных, финансовых и трудовых затрат для разработки количественных индикаторов оценки эффективности расходов, изменения формы предоставления отчетных данных и т.д.
Сложности связаны с определением стратегических целей, тактических задач и показателей деятельности субъектов бюджетного планирования, установлением их значений на среднесрочную перспективу. Особых усилий от местных органов власти потребует разработка ведомственных и долгосрочных целевых программ.
В целях минимизации рисков муниципальным образованиям будет оказана необходимая консультационная и методическая помощь.