Основные риски связаны с изменением бюджетного и налогового законодательства Российской Федерации и, как следствие, доходов и расходов областного бюджета, что может повлиять на качество финансового планирования на долгосрочную перспективу.
Трехлетнее бюджетное планирование требует очень высокой степени надежности макроэкономического прогнозирования. Кроме того, переход к утверждению трехлетнего бюджета необходимо осуществлять и на уровне муниципальных образований области, находящихся в стадии реформирования и неспособных сегодня в полном объеме поддержать инициативу областных властей.
В целях поддержания муниципальных образований в рамках Программы предусмотрено выделение средств на стимулирование реформ на местном уровне и оказание методологической и консультационной помощи, в том числе по вопросам формирования бюджетов на три года.