Координационный совет по организации управления Программой создается при департаменте энергетики и жилищно-коммунального хозяйства области из представителей департамента строительства и средств сообщения области, департамента сельского хозяйства и продовольствия области, комитета природных ресурсов по Калужской области, Государственного комитета по охране окружающей среды Калужской области, Госсанэпиднадзора области, ГП "Калугаоблводоканал".
Координационный совет формирует отчетные данные, организует ведение ежеквартальной статистической отчетности и направляет информацию в Правительство Российской Федерации.
Ежегодно на конкурсной основе определяются исполнители мероприятий Программы, осуществляемых за счет средств областного бюджета.
Организация реализации мероприятий осуществляемых на муниципальном уровне проводится администрацией муниципальных образований.
Ежегодно по результатам прошедшего года координатор Программы докладывает на заседании Правительства области о результатах хода реализации Программы.