Граница сельского поселения «Койдокурское» начинается от точки N 108.
Точка N 108 находится на левом берегу реки Северная Двина в 1,9 км северо-западнее деревни Ивойловская.
От точки N 108 линия границы идет по ломаной линии в юго-восточном, северо-восточном, восточном направлении по левому берегу реки Северная Двина вверх по течению, пересекая протоки Койдокурка, Курьинка, на протяжении 10,1 км до поворотной точки N 114. Точка N 114 находится на левом берегу реки Северная Двина и является крайней северо-западной точкой острова Нижний.
От точки N 114 линия границы идет по ломаной линии в юго-восточном, юго-западном, юго-восточном, южном, юго-западном направлении по западному берегу острова Нижний, пересекая протоку Курьинка, по землям сельскохозяйственного назначения, пересекая озеро Затопляевское, автомобильную дорогу Исакогорка - Новодвинск - Холмогоры, по западной границе кварталов N 1, 18 Холмогорского лесничества Холмогорского лесхоза на протяжении 11,6 км до поворотной точки N 101. Точка N 101 находится на стыке кварталов N 17, 18 Холмогорского лесничества Холмогорского лесхоза. От точки N 101 линия границы идет по прямой линии в северо-западном направлении по северной границе кварталов N 17 - 14 Холмогорского лесничества Холмогорского лесхоза на протяжении 8,8 км до поворотной точки N 100. Точка N 100 находится на стыке квартала N 14 Холмогорского лесничества Холмогорского лесхоза и квартала N 57 Новодвинского лесничества Архангельского лесхоза.
От точки N 100 линия границы идет по ломаной линии в северном, северо-западном направлении по восточной границе кварталов N 57, 37, по северной границе кварталов N 37, 36 Новодвинского лесничества Архангельского лесхоза на протяжении 5,1 км до поворотной точки N 109. Точка N 109 является крайней северо-западной точкой квартала N 36 Новодвинского лесничества Архангельского лесхоза и расположена в 3,5 км юго-восточнее деревни Красная Горка.
От точки N 109 линия границы идет по прямой линии в северо-восточном направлении по землям сельскохозяйственного назначения, пересекая автомобильную дорогу Исакогорка - Новодвинск - Холмогоры, на протяжении 5,2 км до точки N 108, где замыкается. Точка N 108 находится на левом берегу реки Северная Двина в 1,9 км северо-западнее деревни Ивойловская.