Контроль за ходом реализации Программы осуществляется департаментом здравоохранения администрации области, АОФОМС, ЦГСЭН в Архангельской области в порядке, установленном по контролю за реализацией областных целевых программ.
Департамент здравоохранения администрации области отвечает за реализацию Программы в целом, обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, подготавливает доклады о ходе реализации Программы за отчетный год.
Корректировка Программы, в том числе включение в нее новых подпрограмм, продление срока ее реализации осуществляется в установленном порядке по предложению государственного заказчика.
Контроль за реализацией Программы на основе ведомственной отчетности и заключенных договоров (контрактов, соглашений) осуществляет в установленном порядке государственный заказчик.
Контроль включает периодическую отчетность о реализации программных мероприятий, качестве реализуемых программных мероприятий, сроках выполнения договоров.
Исполнители программных мероприятий в установленном порядке отчитываются о целевом использовании выделенных им финансовых средств.