Организация работы по выполнению Программы и контроль за ее реализацией осуществляется департаментом здравоохранения администрации области и департаментом финансов администрации области, а также органами управления здравоохранения совместно с органами местного самоуправления муниципальных образований области.
Департамент здравоохранения администрации области отвечает за реализацию Программы в целом, обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств областного бюджета, разрабатывает и представляет в установленном порядке сводную бюджетную заявку на ассигнования из областного бюджета для финансирования Программы на очередной финансовый год, а также подготавливает доклады о ходе реализации Программы за отчетный год.
Государственный заказчик информирует департамент финансов администрации области и департамент экономического развития Архангельской области обо всех заключенных с исполнителями Программы государственных контрактах (договорах), о их финансировании из областного бюджета, внебюджетных источников.
Корректировка Программы, в том числе включение в нее новых подпрограмм, а также продление срока ее реализации, осуществляется в установленном порядке по предложению государственного заказчика.
Срок действия Программы может продлеваться не более чем на один год. При необходимости продления срока действия Программы более чем на один год разрабатывается новая программа.
Государственный заказчик Программы с участием департамента финансов администрации области и департамента экономического развития Архангельской области организует в установленном порядке экспертные проверки хода ее реализации.
Контроль за выполнением Программы на основе ведомственной отчетности и заключенных договоров (контрактов, соглашений) осуществляет в установленном порядке государственный заказчик.
Контроль включает периодическую отчетность о реализации программных мероприятий и рациональном использовании исполнителями выделяемых им финансовых средств, качестве реализуемых программных мероприятий, сроках выполнения договоров (контрактов, соглашений).
Исполнители программных мероприятий в установленном порядке отчитываются о целевом использовании выделенных им финансовых средств.