Отдел науки и высшей школы администрации области осуществляет контроль за ходом реализации Подпрограммы, обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств областного бюджета, разрабатывает и представляет в установленном порядке бюджетную заявку на ассигнования из областного бюджета для финансирования Подпрограммы на очередной финансовый год, а также подготавливает информацию о ходе реализации Подпрограммы за отчетный квартал и по итогам за год.
Государственный заказчик в своих отчетах информирует департамент финансов администрации области и департамент экономического развития Архангельской области также обо всех заключенных с исполнителями Подпрограммы государственных контрактах (договорах) и их финансировании из областного бюджета.
Корректировка Подпрограммы, в том числе включение в нее новых подпрограмм или мероприятий, а также продление срока ее реализации осуществляется в установленном порядке по предложению отдела науки и высшей школы администрации области.
Срок действия Подпрограммы может продлеваться не более чем на один год. При необходимости продления срока действия Подпрограммы на более длительный период разрабатывается новая программа.
При необходимости департамент финансов администрации области и департамент экономического развития Архангельской области с участием отдела науки и высшей школы администрации области организуют проверки хода реализации Подпрограммы. При этом обращается внимание на выполнение сроков реализации программных мероприятий, целевое и эффективное использование средств, достигнутые результаты.
По результатам проверок готовятся и вносятся на рассмотрение Главы администрации области предложения о целесообразности продолжения работ и финансирования Подпрограммы или об их прекращении.
Контроль включает периодическую отчетность исполнителей о качестве и сроках реализации программных мероприятий и рациональном использовании выделяемых им финансовых средств.