Основной целью развития внутреннего водного транспорта Амурской области является превращение в современную, высокоэффективную и устойчиво функционирующую отрасль транспортного комплекса.
Необходимо обеспечивать полное удовлетворение требований к осуществлению грузовых и пассажирских перевозок, а также решение оборонных, природоохранных и других задач. Для реализации потенциальных возможностей внутреннего водного транспорта необходимо укрепление и развитие его материально-технической базы в соответствии с современными требованиями.
Для достижения поставленных целей инновационного развития речного транспорта на территории области необходимо решить следующие задачи:-
создание специализированных портовых мощностей для освоения новых видов грузопотоков;
обновление обслуживающего флота;
внедрение и обеспечение функционирования системы электронных навигационных карт внутренних водных судоходных путей на реках Амур, Зея и на Зейском водохранилище.