Общее руководство и координацию деятельности исполнителей Программы, а также контроль за целевым и эффективным использование средств, выделенных на реализацию Программы, осуществляет министерство строительства, архитектуры и жилищно-коммунального хозяйства Амурской области.
Контроль за ходом реализации Программы осуществляет Правительство Амурской области.