Текущий контроль за реализацией программы осуществляется министерством здравоохранения области - государственным заказчиком программы.
При необходимости государственный заказчик вносит в установленном порядке предложения об изменении сроков реализации программы.
Контроль ведется на основании государственной статистической отчетности, государственных контрактов и включает:
периодическую отчетность исполнителей о реализации программы;
контроль за целевым и эффективным использованием средств;
контроль за соблюдением сроков и качеством выполнения государственных заказов, объемов работ.
Исполнители отчитываются об использовании выделенных им средств и выполнении программы в соответствии с порядком, установленным государственным заказчиком.
Министерство здравоохранения области представляет в министерство экономического развития и внешних связей области ежемесячные, ежеквартальные, ежегодные итоговые отчеты о ходе и результатах реализации программы и эффективности использования бюджетных средств.