Общее руководство и контроль за ходом реализации программы осуществляет государственный заказчик программы - исполнительный орган государственной власти области, осуществляющий функции в сфере экономического развития и внешних связей.
Заказчик программы совместно с исполнителями программных мероприятий подготавливает обоснования, соглашения, договоры и проводит организационные мероприятия по их выполнению в соответствии с документацией, регламентирующей порядок реализации программы.
Исполнители несут ответственность за выполнение мероприятий программы.
Координацию реализации программных мероприятий осуществляет исполнительный орган государственной власти области, осуществляющий функции в сфере экономического развития и внешних связей, который представляет ежемесячные, ежеквартальные, годовые и итоговый отчеты о ходе и результатах реализации программы и эффективности использования бюджетных средств.
Сводный отчет о реализации мероприятий программы и использовании на эти цели средств областного бюджета представляется в соответствии с Законом Амурской области «Об областных целевых программах».