Основными задачами Управления являются;
- предупреждение и ликвидация заразных и массовых незаразных болезней животных;
- утверждение и разработка планов ветеринарного обслуживания животноводства на территории области;
- обеспечение безопасности продуктов животноводства в ветеринарно-санитарном отношении;
- защита населения от болезней, общих для человека и животных;
- охрана территории Амурской области от заноса заразных болезней животных извне, в том числе из иностранных государств;
- осуществление государственного ветеринарного надзора в соответствии со статьями 8-10 Закона Российской Федерации "О ветеринарии" и Положением о государственном ветеринарном надзоре в Российской Федерации, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 19 06.94 № 706;
- организацией лицензирования ветеринарной деятельности.
( Абзац дополнен Постановлением губернатора области от 26 августа 2003 года № 591)