1. Заказчик ежеквартально представляет Администрации области отчеты об использовании средств фонда.
2. Контроль за использованием средств фонда осуществляют областной Совет народных депутатов и контрольно-счетная палата области.
3. Заказчик и комитет природных ресурсов по Амурской области Министерства природных ресурсов Российской Федерации осуществляют контроль за целевым использованием предприятиями-подрядчиками средств фонда, выделенных для проведения работ по геологическому изучению недр.