1. Комитет возглавляет председатель, назначаемый и освобождаемый от должности в порядке, установленном законодательством Удмуртской Республики.
2. Председатель Комитета имеет заместителя, назначаемого по его представлению Председателем Правительства Удмуртской Республики. Распределение обязанностей между председателем Комитета и его заместителем производится председателем Комитета.
3. Председатель Комитета несет всю полноту ответственности за деятельность Комитета, в том числе за выполнение заключенных Комитетом договоров и соглашений.
4. Председатель Комитета осуществляет руководство Комитетом на основе единоначалия:
действует без доверенности от имени Комитета, представляет его во всех учреждениях и организациях;
представляет интересы Комитета в судебных органах;
назначает на должность и освобождает от должности работников Комитета;
определяет компетенцию своего заместителя;
определяет структуру и штатное расписание в пределах утвержденной сметы;
Федерации и Удмуртской Республики, имуществом и средствами, закрепленными за Комитетом на праве оперативного управления;
издает приказы, распоряжения, утверждает локальные нормативные акты;
осуществляет контроль за действиями подчиненных ему служб, утверждает должностные инструкции руководителей служб и специалистов Комитета;
применяет к работникам Комитета меры поощрения и налагает на них изыскания в соответствии с законодательством Российской Федерации и Удмуртской Республики:
открывает и закрывает в банках расчетные и иные счета, совершает по ним операции, подписывает финансовые документы;
осуществляет права и несет обязанности распорядителя бюджетных средств на содержание Комитета и разрешает другие вопросы, относящиеся к финансово-хозяйственной деятельности Комитета;
принимает меры по эффективному и целевому использованию бюджетных средств, выделяемых на содержание Комитета;
обеспечивает соблюдение финансовой и учетной дисциплины;
несет персональную ответственность (дисциплинарную, административную, уголовную) за неисполнение или нарушение бюджетного законодательства Российской Федерации.
5. При необходимости в Комитете формируется совещательный орган - коллегия. Коллегия образуется в составе председателя Комитета (председатель коллегии), его заместителя (по должности), а также других руководящих работников Комитета. В состав коллегии могут быть включены представители исполнительных органов государственной власти Удмуртской Республики, органов местного самоуправления, организаций, ученые и специалисты. Состав коллегии утверждается постановлением Правительства Удмуртской Республики.
Решения коллегии оформляются протоколами и при необходимости реализуются приказами и распоряжениями председателя Комитета.