Управление Программой осуществляется государственными заказчиками Программы Министерством здравоохранения Удмуртской Республики (государственный заказчик - координатор Программы) и Главным управлением ветеринарии по Удмуртской Республике (государственный заказчик Программы) в соответствии с законодательством.
Государственные заказчики несут ответственность за достижение целей и решение задач Программы, обеспечивают достижения значений целевых индикаторов, показателей эффективности, являются главными распорядителями бюджетных средств, выделяемых на реализацию Программы, отчитываются перед Государственным Советом Удмуртской Республики, Правительством Удмуртской Республики о ходе реализации Программы.
Заказчик Программы организует размещение в средствах массовой информации и (или) в сети Интернет данных о Программе и ее реализации.