Контроль за реализацией Программы осуществляет Министерство здравоохранения Удмуртской Республики.
Министерство финансов Удмуртской Республики проводит выборочные проверки целевого использования средств бюджета Удмуртской Республики, предусмотренных на реализацию Программы.
Министерство здравоохранения Удмуртской Республики организует размещение в сети Интернет текста Программы, правовых актов по управлению реализацией Программы и контролю за ходом выполнения программных мероприятий, информации о фактическом финансировании Программы, заключенных государственных контрактах, об объемах финансирования и исполнителях программ, результатах экспертных проверок выполнения программных мероприятий, конкурсах на участие в реализации Программы, результатах мониторинга реализации Программы, об оценке достижения целевых индикаторов.