Основными задачами Территориальной комиссии являются:
ведение коллективных переговоров по подготовке проекта и заключению Территориального соглашения;
рассмотрение вопросов по инициативе Сторон Территориальной комиссии, возникших в ходе выполнения Территориального соглашения;
осуществление контроля за ходом выполнения Территориального соглашения, разрешение разногласий, возникших в ходе его выполнения, а также урегулирование вопросов, по которым не достигнуто согласие.