1. Госкомитет возглавляет председатель Госкомитета, который назначается на должность Президентом Удмуртской Республики по представлению Председателя Правительства Удмуртской Республики. Председатель Госкомитета освобождается от должности Президентом Удмуртской Республики.
2. Председатель Госкомитета имеет заместителей, назначаемых по его представлению Председателем Правительства Удмуртской Республики. Распределение обязанностей между председателем Госкомитета и его заместителями производится председателем Госкомитета.
3. Председатель Госкомитета несет всю полноту ответственности за деятельность Госкомитета, в том числе за исполнение заключенных Госкомитетом договоров и соглашений.
При осуществлении своих полномочий председатель Госкомитета подотчетен Президенту Удмуртской Республики, Правительству Удмуртской Республики и Председателю Правительства Удмуртской Республики.
4. Председатель Госкомитета осуществляет руководство Госкомитета на основе единоначалия:
действует без доверенности от имени Госкомитета, представляет его во всех учреждениях и организациях;
представляет интересы Госкомитета в судебных органах;
назначает на должность и освобождает от должности работников Госкомитета;
определяет компетенцию своих заместителей:
определяет структуру и штатное расписание в пределах утвержденной сметы;
распоряжается в порядке, установленном законодательством Российской Федерации и законодательством Удмуртской Республики, имуществом и средствами, закрепленными за Госкомитетом на праве оперативного управления;
издает приказы, распоряжения, утверждает локальные нормативные акты;
осуществляет контроль за действиями подчиненных ему служб, утверждает должностные инструкции руководителей служб и специалистов Госкомитета;
применяет к работникам Госкомитета меры поощрения и налагает на них взыскания в соответствии с законодательством Российской Федерации и законодательством Удмуртской Республики;
открывает и закрывает в банках расчетные и иные счета, совершает по ним операции, подписывает финансовые документы;
осуществляет права и несет обязанности распорядителя бюджетных средств на содержание Госкомитета и разрешает другие вопросы, относящиеся к финансово - хозяйственной деятельности Госкомитета;
обеспечивает соблюдение финансовой и учетной дисциплины;
несет персональную ответственность (дисциплинарную, административную, уголовную) за неисполнение или нарушение бюджетного законодательства Российской Федерации.
5. При необходимости в Госкомитете формируется совещательный орган - коллегия. Коллегия образуется в составе председателя Госкомитета (председатель коллегии), его заместителя (по должности), а также других руководящих работников Госкомитета. В состав коллегии могут быть включены представители исполнительных органов государственной власти Удмуртской Республики, органов местного самоуправления, организаций, ученые и специалисты. Состав коллегии утверждается постановлением Правительства Удмуртской Республики.
Решения коллегии оформляются протоколами и при необходимости реализуются приказами и распоряжениями председателя Госкомитета.