Управление системой здравоохранения в Новгородской области осуществляется государственным органом управления здравоохранением, который является структурным подразделением Администрации области.
Основными задачами государственного органа управления здравоохранением области являются:
определение государственной политики и стратегии развития здравоохранения области;
координация деятельности организаций здравоохранения (независимо от форм собственности), организаций в сфере медицинского и фармацевтического образования, медицинской науки, санитарно-эпидемиологической службы области, областного фонда обязательного медицинского страхования, страховых медицинских организаций, общественных объединений в сфере охраны здоровья;
взаимодействие с органами местного самоуправления в решении вопросов здравоохранения, исходя из интересов населения.
Деятельность государственного органа управления здравоохранением области осуществляется в порядке, установленном Администрацией области.