1. Управление возглавляет начальник, назначаемый и освобождаемый от должности главой администрации области по согласованию с Министерством здравоохранения Российской Федерации.
Первый заместитель начальника управления назначатся и освобождается от должности распоряжением главы администрации области.
2. Начальник управления осуществляет руководство на основе единоначалия:
- начальник несет всю полноту ответственности за деятельность управления;
- действует без доверенности, от имени управления представляет его во всех учреждениях и организациях;
- назначает и освобождает от должности руководителей государственных учреждений здравоохранения;
- назначает и освобождает от должности в соответствии с трудовым законодательством работников управления и его подразделений, а также своих заместителей;
- осуществляет руководство деятельностью органов управления здравоохранения по вопросам диагностики, лечения и профилактики заболеваний, а также по другим вопросам, отнесенным к его компетенции;
- издает приказы, инструкции и дает указания на основе и во исполнение законодательства РФ, подлежащие обязательному исполнению учреждениями государственной и муниципальной систем здравоохранения, предприятиями медицинского профиля, организует и проверяет их исполнение;
- распределяет обязанности между заместителями начальника и руководителями структурных подразделений управления;
- утверждает в пределах установленной численности и фонда оплаты труда работников управления структуру, штатное расписание, положения о структурных подразделениях, а также смету расходов на его содержание в пределах утвержденных на соответствующий период ассигнований;
- согласовывает назначение на должность и увольнение руководителей органов здравоохранения городов.
3. В управлении образуется коллегия в составе начальника (председатель коллегии), его заместителей (по должности), руководящих работников управления, других ведомств и организаций Оренбургской области. Количественный состав 17 человек. Члены коллегии утверждаются распоряжением главы администрации области.
Коллегия рассматривает основные вопросы деятельности отрасли. Решения коллегии проводятся в жизнь приказами начальника управления. В случае разногласий между начальником и членами коллегии начальник самостоятельно принимает решение, докладывая о возникших разногласиях администрации области.
4. Управление осуществляет возложенные на него функции как непосредственно, так и через органы власти, а также органы и учреждения здравоохранения городов и районов.