Государственным заказчиком - координатором Программы является министерство здравоохранения Оренбургской области, которое определяет руководителя Программы. Руководитель Программы несет ответственность за реализацию и конечные результаты, рациональное использование выделяемых на ее выполнение финансовых средств, определяет формы и методы управления реализацией Программы.
Реализация Программы осуществляется на основе государственных контрактов, заключенных в соответствии с Федеральным законом "О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд".
Государственные заказчики Программы с учетом выделяемых на реализацию финансовых средств ежегодно уточняют целевые индикаторы и показатели, затраты по мероприятиям Программы, механизм реализации и состав исполнителей.
Государственные заказчики Программы могут на договорной основе передать соответствующим предприятиям, организациям и учреждениям выполнение следующих функций:
сбор и систематизация статистической и аналитической информации о реализации мероприятий Программы;
мониторинг реализации мероприятий Программы.
В целях обеспечения согласованных действий при реализации Программы создается межведомственный совет, формируемый из представителей государственного заказчика - координатора Программы, государственных заказчиков Программы, других органов исполнительной власти, научных организаций, общественных объединений и средств массовой информации.