Управление и контроль за реализацией Программы осуществляет министерство сельского хозяйства, пищевой и перерабатывающей промышленности Оренбургской области, являющийся государственным заказчиком - координатором Программы.
Министерство сельского хозяйства, пищевой и перерабатывающей промышленности Оренбургской области:
обеспечивает согласованность действий по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств федерального бюджета, а также финансирование программных мероприятий за счет областного бюджета и внебюджетных источников;
осуществляет взаимодействие с государственными заказчиками, ответственными за выполнение программных мероприятий;
ежегодно с участием заинтересованных органов исполнительной власти области подготавливает и до 1 февраля представляет в Министерство сельского хозяйства Российской Федерации и в министерство экономического развития, промышленной политики и торговли Оренбургской области доклад о ходе реализации Программы за прошедший год;
организует размещение в сети Интернет текста утвержденной в установленном порядке Программы, нормативных правовых актов, принятых для ее реализации, а также информации о ходе ее реализации.