Реализация Программы осуществляется министерством сельского хозяйства, пищевой и перерабатывающей промышленности Оренбургской области и органами местного самоуправления муниципальных районов и городских округов.
Реализация мероприятий Программы осуществляется на основе соглашений, заключенных министерством сельского хозяйства, пищевой и перерабатывающей промышленности Оренбургской области с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации, о взаимодействии по софинансированию мероприятий за счет средств федерального бюджета и с органами местного самоуправления муниципальных районов и городских округов о выполнении показателей Программы с использованием субвенций, предоставленных в установленном порядке на выполнение отдельных государственных полномочий в сфере регулирования и поддержки сельскохозяйственного производства.
Порядок и условия предоставления субсидий участникам Программы определяются Правительством Оренбургской области.