Финансовые средства Фонда находятся в государственной собственности Российской Федерации, не входят в состав бюджетов всех уровней бюджетной системы Российской Федерации и изъятию не подлежат.
Финансовые средства Фонда образуются за счет:
части единого социального налога по ставкам, устанавливаемым законодательством Российской Федерации, части единого налога на вмененный доход для определенных видов деятельности в установленном размере, а также страховых взносов на обязательное медицинское страхование неработающего населения, предусматриваемых администрациями в соответствующих бюджетах на здравоохранение;
доходов, получаемых от использования временно свободных финансовых средств и нормированного страхового запаса финансовых средств Фонда;
финансовых средств, взыскиваемых со страхователей, медицинских учреждений и других юридических и физических лиц в результате предъявления им исковых либо регрессных требований;
добровольных взносов физических и юридических лиц;
иных поступлений, не запрещенных законодательством Российской Федерации.
Финансовые средства в Фонд перечисляются предприятиями, организациями, учреждениями и иными хозяйствующими субъектами независимо от форм собственности, а также органами исполнительной власти в соответствии с законодательством Российской Федерации.
Норматив финансовых средств, выделяемых Фондом на выполнение филиалами управленческих функций, устанавливается исполнительным директором по согласованию с правлением Фонда.
Бюджет Фонда и отчеты об исполнении бюджета Фонда утверждаются Законодательным Собранием области в форме областных законов.
Временно свободные финансовые средства Фонда в целях защиты их от инфляции используются для размещения банковских депозитов и приобретения высоколиквидных государственных ценных бумаг.
Доходы от использования временно свободных финансовых средств и нормированного страхового запаса финансовых средств Фонда могут быть использованы на следующие цели:
пополнение фондов Фонда;
выравнивание условий деятельности медицинских учреждений, осуществляющих программу обязательного медицинского страхования;
экономическое стимулирование эффективно и качественно работающих медицинских учреждений;
организацию мероприятий по снижению рисков заболеваний среди граждан области.
Конкретный порядок использования указанных средств устанавливается правлением Фонда.