Управление Программой осуществляют:
Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Томской области в части организации мероприятий по капитальному ремонту гидротехнических сооружений муниципальной собственности и бесхозяйных, сооружений, находящихся в ведении Департамента, проведения работ по расчистке и регулированию русел рек;
Департамент архитектуры, строительства и дорожного комплекса Томской области в части организации строительства новых гидротехнических сооружений муниципальной собственности;
органы местного самоуправления муниципальных образований Томской области (по согласованию) в части проведения работ по строительству новых и капитальному ремонту действующих сооружений муниципальной собственности, бесхозяйных гидротехнических сооружений, планируемых к принятию в муниципальную собственность.
Текущий контроль за реализацией Программы осуществляет Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Томской области.
Исполнители Программы представляют отчеты:
по утвержденным формам Министерства природных ресурсов и экологии Российской Федерации и Федерального агентства водных ресурсов в установленные ими сроки заказчику Программы;
ежеквартально, до 5-го числа месяца, следующего за отчетным периодом, представляют заказчику Программы отчетность о реализации Программы и об использовании финансовых ресурсов по установленной заказчиком Программы форме.
Оценка социально-экономической эффективности реализации Программы проводится ежегодно путем сравнения текущих значений основных целевых показателей с установленными Программой значениями.
Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Томской области представляет ежеквартально отчет о реализации Программы в Департамент экономики Администрации Томской области по установленным формам и в установленные сроки.