1. Дума самостоятельно определяет свою структуру.
2. Дума возглавляется председателем. Председатель избирается Думой из своего состава тайным голосованием на первом ее собрании. Председатель Думы избирается на срок полномочий Думы и считается избранным, если за него проголосовало более половины от установленной численности депутатов. Порядок проведения выборов председателя Думы, а также прекращение им своих полномочий определяется Регламентом Думы.
3. Председатель Думы исполняет свои обязанности на постоянной основе.
4. Полномочия председателя Думы:
4.1. организует работу Думы;
4.2. издает постановления и распоряжения;
4.3. представляет Думу в отношениях с населением, органами государственной власти, иными муниципальными образованиями, органами местного самоуправления, предприятиями, организациями и учреждениями;
4.4. координирует деятельность комитетов и комиссий Думы;
4.5. подписывает решения Думы;
(подпункт в редакции, введенной в действие Решением Думы Города Томска от 05 августа 2014 года № 1070, - см. предыдущую редакцию)
4.6. руководит аппаратом Думы, утверждает смету и штатное расписание Думы;
4.7. организует прием граждан, рассматривает заявления и жалобы граждан, принимает по ним решения;
4.8. исполняет иные полномочия в соответствии с настоящим Уставом и Регламентом Думы Города Томска.
5. Заместитель (заместители) председателя Думы избирается (-ются) депутатами Думы из своего состава тайным голосованием.
Порядок проведения выборов заместителя (заместителей) председателя аналогичен порядку проведения выборов председателя Думы.
Полномочия заместителя (заместителей) председателя Думы и их прекращение определяются Регламентом Думы.
6. Из числа депутатов Думы на срок ее полномочий могут создаваться комитеты и комиссии. Структура, порядок формирования, полномочия и организация работы комитетов и комиссий определяются Регламентом Думы, иными решениями Думы.
7. Для организационного и правового обеспечения деятельности Думы, оказания помощи в работе комитетам, комиссиям и депутатам Дума образует свой аппарат. Организация деятельности аппарата Думы регулируется Регламентом Думы.