Проект бюджета государственного внебюджетного Томского территориального фонда обязательного медицинского страхования составляется исполнительной дирекцией фонда, рассматривается правлением указанного фонда и вносится Главой Администрации (Губернатором) Томской области в форме проекта закона о бюджете фонда на очередной финансовый год на рассмотрение Государственной Думы Томской области одновременно с проектом закона об областном бюджете на очередной финансовый год.
Одновременно с проектом бюджета государственного внебюджетного Томского территориального фонда обязательного медицинского страхования представляется смета расходов на выполнение управленческих функций фонда.
Государственная Дума Томской области принимает закон об утверждении бюджета государственного внебюджетного Томского территориального фонда обязательного медицинского страхования одновременно с принятием закона об областном бюджете на очередной финансовый год.