Национальное Иванкинское сельское поселение расположено в северо-западной части Колпашевского муниципального района.
Граница поселения начинается от точки, расположенной в северо-западной части поселения, находящейся в устье реки Мал. Квеж, и проходит в общем восточном направлении по правому берегу протоки Квеж до слияния с рекой Копыловская Кеть, затем на юг, пересекая реку Копыловская Кеть. Далее граница проходит в общем юго-восточном направлении по правому берегу реки Копыловская Кеть, пересекая в южном направлении реку Копыловская Кеть напротив устья истока Инной, затем в юго-восточном направлении по истоку Инной до слияния с протокой Пиджибряк, затем в юго-западном направлении по правому берегу протоки Пиджибряк до слияния с рекой Чаршан, затем на юг на протяжении 4,5 км по правому берегу реки Чаршан, пересекая ее в западном направлении напротив устья протоки без названия, затем граница проходит в юго-западном направлении на протяжении 1,9 км по ручью без названия, затем на запад по прямой линии на протяжении 0,5 км до пересечения с правым берегом реки Обь в 4,0 км на юго-восток от истока протоки Пуриянга. Далее граница проходит в юго-западном направлении, пересекая реку Обь, до устья реки Кажу, затем в южном направлении по левому берегу реки Обь на протяжении 3,5 км, затем, совпадая с линией границы межселенной территории, в западном направлении по южной линии контура болота до пересечения с ручьем без названия, далее по ручью без названия, находящемуся в квартале 49 Шудельского лесничества Колпашевского лесхоза, на протяжении 1,1 км. Затем, совпадая с линией границы межселенной территории, в северном направлении параллельно магистральному газопроводу на расстоянии 1,0 км от него до пересечения с рекой Исток, далее в общем северо-восточном направлении по реке Исток (против течения) до пересечения с зимником, затем в восточном направлении, пересекая зимник, на протяжении 0,6 км до реки Кажу, затем в общем северо-восточном направлении по реке Кажу до впадения в реку Обь. Далее, совпадая с линией границы межселенной территории, граница проходит в северном направлении по левому берегу реки Обь на протяжении 8,0 км. Затем на восток, пересекая реку Обь и остров без названия, до устья протоки Полой, далее по протоке Полой на протяжении 0,4 км до устья ручья без названия, затем граница проходит в северном направлении по ручью и восточным берегам озер без названия на протяжении 1,7 км, далее в общем северо-западном направлении по пересыхающему ручью без названия на протяжении 2,2 км, затем в северо-восточном направлении на протяжении 3,7 км до южного берега озера Русалево. Далее на север по западному берегу озера Русалево до истока Русалево, затем в общем северо-восточном направлении по истоку Русалево до слияния с рекой Мал. Квеж, затем в северном направлении по реке Мал. Квеж до слияния с протокой Квеж - первоначальной точкой описания.
(Абзац в редакции, введенной в действие Законом Томской области от 6 июля 2012 года № 126-ОЗ, - см. предыдущую редакцию)