Площадь поселения 207018 га.
Михайловское сельское поселение расположено в восточной части Зырянского муниципального района. На северо-востоке Михайловское сельское поселение граничит с Тегульдетским районом, граница с которым начинается от смежества границ Михайловского и Чердатского сельских поселений с границей Тегульдетского района. Граница проходит по реке Четь вверх по течению притока до реки Тонгул, далее вверх по реке Тонгул до границы с Кемеровской областью, с которой Михайловское сельское поселение граничит с юго- восточной и южной стороны. Граница с Кемеровской областью проходит от реки Тонгул по землям гослесфонда Кийского лесничества, по ручью Большой Альдебет, пересекая реку Малый Тонгул и далее по землям гослесфонда до границы Высоковского сельского поселения на реке Кия.
С юго-восточной стороны Михайловское сельское поселение граничит с Высоковским сельским поселением, граница с которым проходит вниз по течению реки Кия до земель гослесфонда урочища "Туендатское", далее по восточной и южной границе земель гослесфонда Кийского лесничества и далее по смежным землям сельхозназначения Михайловского и Высоковского сельских поселений до границы с Кемеровской областью. Граница с Кемеровской областью проходит по реке Кильдедек, по землям сельхозназначения бывшего колхоза им. В. Кингисеппа, на которых граница с Кемеровской областью заканчивается.
На западе и северо-западе Михайловское сельское поселение граничит с Дубровским сельским поселение, граница с которым начинается от границы с Кемеровской областью, проходит по смежным землям сельхозназначения Михайловского и Дубровского сельских поселений, пересекая реку Туендат, и в районе урочища "Михайловский высел" выходит на границу Зырянского сельского поселения, с которым Михайловское сельское поселение граничит на западе и северо-западе. Граница проходит по смежным землям сельхозназначения Михайловского и Зырянского сельских поселений через урочище "Солонцы" до реки Кия, далее вниз по течению реки Кия, по её правобережью до смежества границ Михайловского, Зырянского и Чердатского сельских поселений в районе озера Иржик. На севере Михайловское сельское поселение граничит с Чердатским сельским поселением, граница с которым от озера Иржик проходит по смежным сенокосным угодьям до реки Четь и далее вверх по реке Четь до смежества границ Михайловского и Чердатского сельских поселений с Тегульдетским районом.