Губернатор Томской области обладает следующими полномочиями:
1) представляет Томскую область в отношениях с Президентом Российской Федерации, Федеральным Собранием Российской Федерации, Правительством Российской Федерации, Государственным Советом Российской Федерации, иными органами, организациями и должностными лицами и при осуществлении внешнеэкономических связей в пределах компетенции Томской области, вправе подписывать договоры и соглашения от имени Томской области;
2) подписывает и обнародует законы Томской области либо отклоняет законы, принятые Законодательной Думой Томской области;
3) обеспечивает координацию деятельности исполнительных органов Томской области с иными органами государственной власти Томской области и в соответствии с законодательством Российской Федерации организует взаимодействие исполнительных органов Томской области с федеральными органами исполнительной власти и их территориальными органами, органами местного самоуправления, иными органами, входящими в единую систему публичной власти в Российской Федерации;
4) определяет основные направления деятельности Администрации Томской области;
5) представляет в Думу проекты стратегии социально-экономического развития области, областного бюджета, отчет об исполнении областного бюджета, сводный годовой доклад о ходе реализации и об оценке эффективности государственных программ Томской области, ежегодные отчеты о ходе исполнения плана мероприятий по реализации стратегии социально-экономического развития Томской области;
6) представляет в Думу ежегодные отчеты о результатах деятельности исполнительных органов Томской области, в том числе по вопросам, поставленным Думой;
7) обладает правом законодательной инициативы в Думе;
8) вносит в Думу представления по согласованию назначения на должности первых заместителей Губернатора Томской области, а также представляет для утверждения на должность заместителя Губернатора Томской области - руководителя финансового органа Томской области. Процедура согласования назначения на должности, утверждения на должности указанных должностных лиц происходит путем тайного голосования в порядке, предусмотренном Регламентом Думы;
9) утверждает положения о структурных подразделениях Администрации Томской области, положения об иных исполнительных органах Томской области, образующих соответственно структуру Администрации Томской области, иных исполнительных органов Томской области;
10) наделяет полномочиями сенатора Российской Федерации - представителя от Администрации Томской области;
11) от имени Администрации Томской области подписывает исковые заявления, иные документы, направляемые в суд;
12) вправе требовать созыва внеочередного собрания Думы, а также созывать вновь избранную Думу на первое собрание ранее срока, установленного для этого Думе Уставом Томской области;
13) вправе участвовать в работе Думы с правом совещательного голоса или направлять своего официального представителя;
14) вправе принять решение о досрочном прекращении полномочий Думы по основаниям и в порядке, предусмотренным федеральным законом об общих принципах организации публичной власти в субъектах Российской Федерации;
15) вправе вынести предупреждение, объявить выговор главе муниципального образования Томской области, главе местной администрации за неисполнение или ненадлежащее исполнение обязанностей по обеспечению осуществления органами местного самоуправления отдельных государственных полномочий, переданных органам местного самоуправления федеральными законами и (или) законами Томской области;
16) вправе отрешить от должности главу муниципального образования Томской области, главу местной администрации в случае, если в течение месяца со дня вынесения Губернатором Томской области предупреждения, объявления выговора главе муниципального образования Томской области, главе местной администрации в соответствии с пунктом 15 настоящей статьи главой муниципального образования Томской области, главой местной администрации не были приняты в пределах своих полномочий меры по устранению причин, послуживших основанием для вынесения ему предупреждения, объявления выговора;
17) вправе обратиться в представительный орган муниципального образования Томской области с инициативой об удалении главы муниципального образования Томской области в отставку, в том числе в случае систематического недостижения показателей для оценки эффективности деятельности органов местного самоуправления в порядке, установленном федеральным законом об общих принципах организации местного самоуправления;
18) осуществляет иные полномочия в соответствии с федеральным законом об общих принципах организации публичной власти в субъектах Российской Федерации, другими федеральными законами, Уставом Томской области, законами области.