Администрация Томской области обладает следующими полномочиями:
1) участвует в проведении единой государственной политики в сферах финансов, науки, образования, здравоохранения, культуры, физической культуры и спорта, социального обеспечения, безопасности дорожного движения и экологии;
2) осуществляет меры по реализации, обеспечению и защите прав и свобод человека и гражданина, охране собственности и общественного порядка, противодействию терроризму и экстремизму, борьбе с преступностью;
3) обеспечивает разработку и осуществление мер, направленных на социально-экономическое развитие Томской области;
4) осуществляет меры по сохранению и развитию этнокультурного многообразия народов Российской Федерации, проживающих на территории Томской области, их языков и культуры; защите прав коренных малочисленных народов и других национальных меньшинств; социальной и культурной адаптации мигрантов; профилактике межнациональных (межэтнических) конфликтов и обеспечению межнационального и межконфессионального согласия;
5) осуществляет меры по координации вопросов здравоохранения, в том числе обеспечению оказания доступной и качественной медицинской помощи, сохранению и укреплению общественного здоровья, созданию условий для ведения здорового образа жизни, формированию культуры ответственного отношения граждан к своему здоровью;
6) осуществляет меры по обеспечению государственных гарантий социальной защиты населения, включая социальное обеспечение, адресной социальной поддержки граждан;
7) осуществляет меры по обеспечению защиты семьи, материнства, отцовства и детства, защиты института брака как союза мужчины и женщины, по созданию условий для достойного воспитания детей в семье, а также для осуществления совершеннолетними детьми обязанности заботиться о родителях;
8) устанавливает порядок составления проекта областного бюджета;
9) готовит ежегодный отчет о результатах деятельности исполнительных органов Томской области, сводный годовой доклад о ходе реализации и об оценке эффективности государственных программ Томской области для представления их Губернатором Томской области в Думу;
10) управляет и распоряжается областной собственностью в соответствии с законами Томской области, а также управляет федеральной собственностью, переданной в управление Томской области в соответствии с федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации;
11) определяет порядок разработки и корректировки документов стратегического планирования, находящихся в ведении Администрации Томской области, утверждает (одобряет) такие документы;
12) готовит ежегодные отчеты о ходе исполнения плана мероприятий по реализации стратегии социально-экономического развития Томской области для представления их Губернатором Томской области в Думу;
13) учреждает печатное средство массовой информации, сетевое издание для обнародования (официального опубликования) правовых актов органов государственной власти Томской области, иной официальной информации, создает и обеспечивает функционирование официальных сайтов исполнительных органов Томской области;
14) вносит предложения органу местного самоуправления, должностному лицу местного самоуправления муниципального образования Томской области о приведении в соответствие с законодательством Российской Федерации изданных ими правовых актов в случае, если указанные акты противоречат Конституции Российской Федерации, федеральным конституционным законам, федеральным законам и иным нормативным правовым актам Российской Федерации, Уставу Томской области, законам и иным нормативным правовым актам Томской области, а также вправе обратиться в суд;
15) осуществляет иные полномочия, установленные федеральными законами, Уставом Томской области, законами Томской области, соглашениями с федеральными органами исполнительной власти, а также установленные нормативными правовыми актами Президента Российской Федерации и нормативными правовыми актами Правительства Российской Федерации, предусматривающими передачу осуществления органам исполнительной власти Томской области отдельных полномочий федеральных органов исполнительной власти.