Система программных мероприятий включает пять направлений:
- стимулирование существующих организаций к использованию инноваций;
- содействие созданию малых инновационных предприятий;
- привлечение внешних инвестиций в инновационную сферу;
- развитие инфраструктуры инновационной деятельности;
- повышение уровня инновационной культуры в регионе.
Первые два направления определяют целевые группы для реализации программы, а три остальных закладывают механизмы достижения поставленных целей.
План конкретных мероприятий по реализации программы на 2003 по пяти направлениям утверждается Государственной Думой Томской области, на последующие годы - Главой Администрации (Губернатором) Томской области.