Реализация Программы предусматривается на основе двусторонних соглашений между Правительством Пензенской области и Министерством по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Пензенской области.
В ходе реализации Программы Министерство по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Пензенской области уточняет объемы финансирования на реализацию мероприятий Программы, обеспечивает координацию и контроль за ходом реализации мероприятий и эффективным использованием средств непосредственными исполнителями.