Координатором Программы является Правительство Пензенской области, которое осуществляет общий контроль и несет ответственность за выполнение мероприятий данной Программы по созданию инновационной инфраструктуры Пензенской области.
Контроль за целевым использованием выделенных Центру средств осуществляют главные распорядители средств бюджета Пензенской области - Правительство Пензенской области и Управление экономики Пензенской области. Головной исполнитель осуществляет контроль и несет ответственность за целевое использование финансовых средств организациями-исполнителями комплексных и инфраструктурных проектов Программы (абзац в редакции, введенной в действие со 2 октября 2006 года Законом Пензенской области от 12 сентября 2006 года N 1102-ЗПО, - см. предыдущую редакцию).
Организации-исполнители комплексных проектов представляют головному исполнителю ежегодные информационно-аналитические и финансовые отчеты о ходе выполнения комплексных проектов с отражением достигнутого уровня показателей социально-экономической эффективности. Головным исполнителем составляются итоговые информационно-аналитический и финансовый отчеты и представляются на утверждение государственному заказчику - Правительству Пензенской области.
После утверждения информационно-аналитического и финансовых отчетов государственным заказчиком они направляются федеральным органам исполнительной власти, принимавшим участие в долевом финансировании Программы.
При необходимости корректировки сроков реализации Программы головной исполнитель вносит соответствующие предложения на рассмотрение государственного заказчика с объяснением причин и обоснованием необходимости продления сроков.