Реализация Программы предусматривается на основе двусторонних соглашений между Правительством Пензенской области и Министерством образования и науки Российской Федерации, Правительством Пензенской области и органами местного самоуправления муниципальных образований Пензенской области.
В ходе реализации Программы Министерство образования и науки Пензенской области, Министерство здравоохранения и социального развития Пензенской области и Министерство культуры Пензенской области ежегодно уточняют объемы финансирования на реализацию мероприятий программы, обеспечивают координацию и контроль за ходом реализации мероприятий и эффективным использованием средств непосредственными исполнителями.