Контроль за деятельностью областного фонда осуществляет ревизионная комиссия.
Правление областного фонда по мере необходимости, но не реже одного раза в год, назначает аудиторскую проверку деятельности областного фонда, осуществляемую специализированной организацией, имеющей соответствующую лицензию. Отчет о результатах этой проверки представляется областной Думе и администрации области.
Отчет о доходах и использовании средств областного фонда, а также о результатах его деятельности представляется ежегодно администрации области, а также Федеральному фонду обязательного медицинского страхования.
Областной фонд ведет учет и отчетность в установленном порядке.