Выполнение функций по управлению Программой, а также по осуществлению контроля за ходом ее реализации распределяется следующим образом:
1. Контроль за целевым использованием денежных ресурсов выполняется департаментом сельского хозяйства и продовольствия Администрации Самарской области и департаментом финансов Администрации Самарской области.
2. Контроль за внедрением высокоэффективной технологии осуществляется департаментом сельского хозяйства и продовольствия Администрации Самарской области совместно со специалистами компании "АГТ Системс ГмбХ" и закрытого акционерного общества "Системы менеджмента и производства".