Министерство здравоохранения Нижегородской области осуществляет управление реализацией Программы, обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств, подготавливает информационные справки и аналитические доклады о ходе её реализации. (в ред. постановления Правительства области от 26.02.2008 № 55- см. предыдущую редакцию)
Контроль за ходом реализации Программы осуществляет Правительство Нижегородской области.
Формой контроля служит отчет по финансированию мероприятий Программы из областного бюджета, составляемый министерством здравоохранения Нижегородской области. Отчет о ходе выполнения Программы представляется министерством здравоохранения Нижегородской области в марте 2009 года заместителю Губернатора, заместителю Председателя Правительства Нижегородской области по социальной политике. (в ред. постановления Правительства области от 26.02.2008 № 55- см. предыдущую редакцию)