Координация деятельности исполнителей основных мероприятий Программы осуществляется министерством здравоохранения Нижегородской области.
Министерство здравоохранения Нижегородской области совместно с основными исполнителями формирует сводную бюджетную заявку на каждый бюджетный год, предусматривая в ней объемы ассигнований на реализацию программных мероприятий с учетом инфляции.
Министерство здравоохранения Нижегородской области осуществляет контроль над целенаправленным и эффективным использованием выделенных бюджетных средств.
Правительство Нижегородской области как государственный заказчик Программы проводит оценку эффективности выполнения запланированных мероприятий по информации, предоставляемой основными исполнителями.