Целями Программы на период до 2020 года являются:
1) гарантированное обеспечение водными ресурсами;
2) обеспечение защищенности населения и объектов экономики от наводнений и иного негативного воздействия вод;
3) сохранение и восстановление водных объектов до состояния, обеспечивающего экологически благоприятные условия жизни населения.
Для достижения поставленных целей планируется решить следующие задачи:
1) ликвидация дефицитов водных ресурсов;
2) строительство сооружений инженерной защиты и повышение эксплуатационной надежности гидротехнических сооружений путем их приведения к безопасному техническому состоянию;
3) восстановление и экологическая реабилитация водных объектов, утративших способность к самоочищению.