Главными задачами главного управления ветеринарии являются:
2.1. Руководство ветеринарной службой области, совершенствование ее работы на основе передового ветеринарного опыта и научно-технического прогресса, координация деятельности подразделений, входящих в систему государственной ветеринарной службы области.
2.2. Контроль за выполнением органами исполнительной власти, органами местного самоуправления, и их должностными лицами, организациями, иными хозяйствующими субъектами независимо от их подчиненности, форм собственности и организационно-правовых форм, общественными объединениями, международными организациями, иностранными юридическими лицами гражданами Российской Федерации, иностранными гражданами и лицами без гражданства - владельцами животных и продуктов животного происхождения, ветеринарного законодательства Российской Федерации на территории Омской области.
2.3. Организация ветеринарных мероприятий по обеспечению охраны территории области от заноса из других субъектов Российской Федерации и зарубежных государств возбудителей заразных болезней животных и ввоз на территорию области некачественных в ветеринарно-санитарном отношении продукции и сырья животного происхождения.
2.4. Осуществление государственного ветеринарного надзора, ветеринарно-санитарное обеспечение безопасности продуктов животноводства в сельскохозяйственных и перерабатывающих организациях.
2.5. Охрана населения от болезней, общих для человека и животных.
2.6. Разработка и реализация областных программ по предупреждению и ликвидации карантинных и особо опасных болезней животных, в том числе болезней общих для человека и животных.
2.7. Организация и повышение эффективности государственного ветеринарного надзора на подконтрольных объектах.
2.8. Разработка предложений по совершенствованию ветеринарного законодательства Российской Федерации и механизму реализации действующих нормативных правовых актов, участие в формировании нормативной правовой базы области по вопросам ветеринарного дела.