Управление реализацией Программы и контроль за ее выполнением осуществляет главное управление здравоохранения Администрации области совместно с комитетом финансов и контроля Администрации области и другими заинтересованными областными органами исполнительной власти.
Ежегодно на заседаниях коллегии главного управления здравоохранения Администрации области рассматриваются вопросы с ходе реализации программных мероприятий и об эффективности использования финансовых средств.
Информация и доклады о ходе выполнения Программы и об использовании средств бюджета всех уровней, внебюджетных средств представляются в установленном порядке.